El Observatorio de Ecología Microbiana (OEM) es un laboratorio de investigación y un espacio de formación orientado al estudio del microbioma ambiental, los microorganismos y su rol biogeoquímico en el ecosistema, con énfasis en el ambiente acuático tanto marinos como en humedales (altura y costeros), sometidos a gradientes físicos y químicos, en ocasiones extremos.